Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED16Q9Y2X0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms