Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms