Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFMBT1Q9UHJ3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms