Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms