Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KLHL9Q9P2J3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KLHL9Q9P2J3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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