Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms