Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM8Q9BZR9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms