Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPIFA3Q9BQP9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms