Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms