Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-CQ95604 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms