Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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