Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3AQ92484 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms