Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC103Q8IW40 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC103Q8IW40 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC103Q8IW40 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC103Q8IW40 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms