Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms