Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP21-3Q3LHN1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP21-3Q3LHN1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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