Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIR3

EIF2S3L, Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2S3LQ2VIR3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EIF2S3LQ2VIR3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EIF2S3LQ2VIR3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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