Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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