Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SSX1Q16384 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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