Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD3Q15054 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms