Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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