Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms