Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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