Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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