Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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