Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms