Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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