Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms