Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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