Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COX10Q12887 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COX10Q12887 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms