Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms