Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms