Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms