Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms