Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB4BP68371 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms