Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms