Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFC1P60507 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms