Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP2P42575 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP2P42575 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP2P42575 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms