Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms