Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms