Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCM3P25205 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCM3P25205 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms