Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms