Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB6P18564 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms