Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMC1P11047 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms