Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTMAP06454 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTMAP06454 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms