Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSVO60911 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSVO60911 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms