Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB3O43889 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREB3O43889 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB3O43889 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms