Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA2O43364 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms