Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC182A6NF36 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC182A6NF36 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC182A6NF36 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC182A6NF36 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCDC182A6NF36 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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