Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms