Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms